國有資本經(jīng)營預(yù)算與其他預(yù)算相比，起步晚、經(jīng)驗少，面臨著更加困難和復(fù)雜的局面，既有預(yù)算管理共性問題，又有國有資本經(jīng)營預(yù)算的個性問題。

（一）預(yù)算范圍不完整

國有資本經(jīng)營預(yù)算不斷推進，預(yù)算編制范圍逐步擴大，預(yù)算編制完整性不斷提高，但仍有部分企業(yè)游離于國有資本經(jīng)營預(yù)算以外。國有資本經(jīng)營預(yù)算尚未實現(xiàn)全覆蓋。

（二）預(yù)算編報不細化

細化預(yù)算是指在年初預(yù)算編制時即將資金落實到具體單位和項目，是提高政府預(yù)算管理水平的必然要求，也是實現(xiàn)科學(xué)預(yù)算、杜絕資金二次分配和權(quán)力尋租，保證預(yù)算執(zhí)行剛性的前提。但國有資本經(jīng)營預(yù)算由于起步時間晚，管理水平不高，預(yù)算編報較為粗放。

（三）預(yù)算執(zhí)行不規(guī)范

一是預(yù)算執(zhí)行不均衡。國有資本收益包括：應(yīng)交利潤，國有股股息、股利，國有產(chǎn)權(quán)轉(zhuǎn)讓收入，企業(yè)精算收入，其他國有資本經(jīng)營收益。其中，應(yīng)交利潤是國有資本收益的主要組成部分，但由于目前企業(yè)集團化后，子公司及分支機構(gòu)眾多，公司編制合并財務(wù)會計報表、審計等事項需要較長時間，導(dǎo)致應(yīng)交利潤確定的時間較晚。而國有資本收益預(yù)繳和與各預(yù)算間的庫款調(diào)劑制度又尚未建立，導(dǎo)致預(yù)算執(zhí)行極不均衡。二是列支項目不準(zhǔn)確。國有資本經(jīng)營預(yù)算在按照預(yù)算科目列收支的基礎(chǔ)上，還按照資金投向分設(shè)了不同的項目，如企業(yè)兼并重組、國有經(jīng)濟和產(chǎn)業(yè)結(jié)構(gòu)調(diào)整、新興產(chǎn)業(yè)發(fā)展等項目。項目管理符合國有資本經(jīng)營預(yù)算特點，便于社會公眾掌握國有資本經(jīng)營預(yù)算的支出方向，增強了預(yù)算透明度。但由于項目之間界限不清晰等原因，導(dǎo)致預(yù)算實際支出情況與項目內(nèi)容不符。

（四）預(yù)算定位不清晰

一是預(yù)算功能界定不明確，國有資本經(jīng)營預(yù)算與公共財政預(yù)算、基金預(yù)算之間存在補助內(nèi)容交叉、支出對象相同的問題。二是預(yù)算資金投向競爭領(lǐng)域，部分項目資金存在少、散的現(xiàn)象。

國有資本經(jīng)營預(yù)算設(shè)立的目的是鞏固和發(fā)展國有經(jīng)濟，集中解決國有企業(yè)改革中存在的體制性和機制性問題，實現(xiàn)國有企業(yè)的轉(zhuǎn)型和升級，使國有企業(yè)更好地為國民經(jīng)濟服務(wù)。審計應(yīng)以此切入點，重點審查國有資本經(jīng)營預(yù)算實施效果。一是審查國有資本經(jīng)營預(yù)算功能是否清晰，是否與其他預(yù)算之間存在交叉。利用計算機技術(shù)，對國有資本經(jīng)營預(yù)算、公共財政預(yù)算和基金預(yù)算投入企業(yè)和項目的情況進行比對，查找是否存在資金投向、支出企業(yè)和項目內(nèi)容重復(fù)的問題，以揭示國有資本經(jīng)營預(yù)算與其他預(yù)算之間若能交叉、定位不清的問題。二是審查資金投向是否屬于關(guān)鍵領(lǐng)域及重點行業(yè)。對國有資本經(jīng)營預(yù)算的支出投向進行審計審計，分析資金投向是否屬于國有經(jīng)濟布局和結(jié)構(gòu)調(diào)整、國家戰(zhàn)略和國家安全等關(guān)鍵領(lǐng)域及重點行業(yè)，有無投入房地產(chǎn)、旅游等完全競爭行業(yè)的問題，以揭示國有資本經(jīng)營預(yù)算投向不符合預(yù)算設(shè)立目的，未能充分體現(xiàn)政策要求的問題。

（二）預(yù)算執(zhí)行情況的審計

一是審查預(yù)算執(zhí)行與編制的一致性。審查預(yù)算編制時已明確單位和項目的預(yù)算是否得到了嚴格執(zhí)行，如存在項目調(diào)整情況，審查預(yù)算調(diào)整程序是否合規(guī)，是否經(jīng)過原審批機關(guān)批準(zhǔn)。對年初財政代編和編報時只明確支也方面的預(yù)算，應(yīng)審查預(yù)算執(zhí)行中企業(yè)和項目確定的程序，查閱財政部分提供的企業(yè)申報資金和項目審批文件，關(guān)注是否存在預(yù)算執(zhí)行隨意性大，預(yù)算缺乏剛性的問題。二是審查預(yù)算收入執(zhí)行情況。國有資本經(jīng)營預(yù)算資金采取當(dāng)年收入、當(dāng)年支出方式，預(yù)算資金入庫進度與預(yù)算支出進度緊密相連。審計人員應(yīng)查閱上交國有資本收益企業(yè)財務(wù)報表和財政部門相關(guān)收益上交比例政策文件，審查相關(guān)企業(yè)國有資本收益確定是否準(zhǔn)確、上交是否及時、入庫是否完整。三是審查實際投向與項目內(nèi)容是否一致。

以中央企業(yè)兼并重組、國有經(jīng)濟和產(chǎn)業(yè)結(jié)構(gòu)調(diào)整、中央企業(yè)重大科技創(chuàng)新、中央企業(yè)重大節(jié)能減排等項目為抓手進行審計，核實相關(guān)項目實際支出內(nèi)容，審查其實際投向與項目內(nèi)容是否一致。對項目資金投入集中度進行分析，審查是否存在資金平均分配及少、散等影響資金使用效益的問題。

（三）預(yù)算分配情況的審計

預(yù)算分配是對納入政府預(yù)算體系的財政資源進行配置的行為。預(yù)算分配審計的內(nèi)容主要包括兩個方面：一是審查預(yù)算單位完整性。國有資本經(jīng)營預(yù)算要求所有國有企業(yè)都納入預(yù)算實施范圍，審計人員開展工作時應(yīng)從財政部門調(diào)查國有資本經(jīng)營預(yù)算的編報范圍和編報單位，與國資部門掌握的金融企業(yè)名單和其他履行出資人職責(zé)的單位所屬企業(yè)名單進行比較，審查是否存在國有資本經(jīng)營預(yù)算未涵蓋本級政府和部門全部所屬企業(yè)的問題。二是審查預(yù)算編報準(zhǔn)確性。通過審閱年初預(yù)算編報資料，檢查年初預(yù)算是否細化到具體的項目和執(zhí)行單位。對財政部門代編和國資委等部門分配的國有資本經(jīng)營預(yù)算項目進行比對分析，檢查在補助對象、支持投向和使用范圍方面是否存在交叉，導(dǎo)致項目重復(fù)，影響資金使用效益的問題。